去年，民进南京市委提交了一份集体提案，建议重新规划建设南京大报恩寺遗址公园，以“长干里佛教遗址公园”来取而代之，以涵盖长干寺、大报恩寺以及历史上这里曾经有过的其他寺院的文化。委员们认为，虽然大报恩寺在佛教发展史上有着特殊的地位，但是长干寺内出土的七宝阿育王塔以及其中可能藏有的佛顶真骨和感应舍利等，意义非同寻常，其佛教地位和考古地位超过了大报恩寺塔。而且已经发掘了长干寺地宫，遗址原有的规划设计就不具备科学性与合理性了。

　　不过一年过去，大报恩寺园区建设也没有什么动静，为此，民进南京市委在今年的南京市两会上再次进言，建议不要光“纠结”于大报恩寺上了，借此机会设立一个综合规划的“大遗址保护区”，初步设想是，这个区域内的考古勘探发掘部分全貌保留，这是园区的精华部分，并设立主题博物馆，展示东吴建初寺以来这个地区历史文化演进的全貌，其中建初寺、长干寺、大报恩寺等佛教文化可以做重点展示。整个遗址的范围要向四周适当扩大，可北至中华门，南至雨花台，东至晨光路，西至雨花路。

　　但这样的想法也有反对的声音，有专家认为，国内不缺类似的景点，没有必要把摊子铺那么大，还是应该主题鲜明，在这些佛教寺庙中，还是大报恩寺的影响力最大，因此可以坚持原来的规划，再将长干寺地宫的文物请回去供奉，也并不矛盾。

大报恩寺塔确定原址复建

　　按照最初的规划，大报恩寺遗址上要原汁原味复建一座大报恩寺琉璃塔，这也是最大的亮点，季建业昨天也表示，将重建大报恩寺塔永久供奉佛祖舍利。但是大报恩寺及寺塔在哪里恢复重建，至今也有两种声音。

原址复建派：

　　谈到原先的遗址规划，潘谷西表示：“现在暂时被搁置了。”他也听说关于在哪儿重建大报恩寺和琉璃塔，目前有不同的声音，不过他坚持认为，不管规划变不变，琉璃塔还是应该在原来遗址的范围内复建，“跑别的地方去复建，就不叫大报恩寺塔了。”在潘谷西看来，在原来的遗址范围才叫“复建”，在别的地方就是“重建”了，而重建就可以建别的寺塔，不一定是大报恩寺。

迁址重建派：

　　南京市政协委员、玄奘寺住持传真也赞成恢复大报恩寺和寺塔，但他的建议是：迁址重建，推荐的新址是江宁的牛首山风景区。

　　传真认为，现在的遗址范围非常狭小，要在原址上恢复报恩寺和报恩寺塔，不管是在规模上、建筑格局上、游客的接待与承载能力上，还是塔身的体量高低上，都不能展示其在历史上的辉煌，更难体现在其历史上的佛都文化中心的地位。