蒋介石所进行的国民党改造，主要的不是思想整顿，而是一次人事和权力结构上的重新组合，这就势必要有改造打击的目标。这样，由于桂系与蒋介石结怨最深，所以，蒋介石自然要把改造的重点目标对准以李宗仁、白崇禧为代表的桂系集团。

　　改造和打击的第二个重点目标就是陈果夫、陈立夫两兄弟所把持的党务系统的“CC”系。1950年7月22日，国民党中央常委会召开临时会议，通过了由蒋经国、张其昀起草的《中国国民党改造案》，正式决议进行国民党改造。蒋介石在会上“希望全党同志，同心协力，推动改造工作”。时隔4天，他又以“总裁”身份提出了16人的中央改造委员会委员名单。8月5日，中改会通过《组织大纲》和《本党改造纲要》。蒋介石对国民党改造寄予厚望，他说：“今天整个国家的生死存亡，系于本党此次改造的成败。各位同志应以临深履薄戒慎恐惧的心情，同心同德相辅相成，把台湾建成一个三民主义的模范省。”蒋介石说得很轻松，但这些话对陈果夫、陈立夫来说却是相当沉重，他们仿佛有一种奔赴刑场的感觉。的确，他们不得不承认，他们不想看到的这一天终于来了。